如何在 Achleous平台上将作业投递到指定节点

生物信息分析软件在运行过程中，经常面临相对复杂的运行需求。例如，基因组组装任务占用内存较大，且内上限不明确；而另一些科研院所内，不同的项目组的集群队列由相关部门统一管理，需要不同来源的计算任务运行于不同的队列中；有时需要对一部分计算机器进行资源预留，但在计算空闲时需要对一部分小任务能进行计算。Achelous 保证将用户调度到合适的计算节点，可以访问需要的存储和硬件资源。但在某些特殊场景下，用户可能要求计算被调度到指定的计算节点。

情形1：使用"胖节点"

某些生物计算任务需要使用超大内存节点，因此计算任务需要调度到指定的胖节点。用户需要在Task的runtime属性中指定ServerType，例如：

task analysis {
    …
    command {…}

runtime {
    …
    servertype: "fat" ### 指明该任务只能在"胖节点" 进行运行
    …
}
    …

情形2: 指定计算节点的属性

处于某些管理需求，系统管理员可能会将计算服务器分成某些区域或者组，为每个节点打上类似Key/Value对的标签。流程编写者在编写对应的 WDL脚本时，可以通过在Task的runtime属性slaveconstraint或者Job JSON的constraints中指定计算节点需要满足的Key/Value对。例如：

task analysis {
    ...
    command {...}
    runtime {
        ...
        slaveconstraint:  {
            "region" :"region1",
            "group" :"group1"
    }
    ...
}

作业提交时，用户在Job的JSON中指定Constraints属性，则这个Job的所有Task将自动具备了对应的SlaveConstraints属性。例如：

{
...
    "Constraints":{
       "region": "region1",
       "group" : "group1"
    }
}

上面的Job提交后，则全部任务都会在集群中，对应的 region1和group1 的计算节点上运行。

如果需要指定任务在某个特定节点上运行，则可以在Job文件中指定：

{
    "Constraints":  { "hostname" : "Cc2BCluster" } ### 通过hostname指定作业
}

情形3：使用 Poros中调度域配置进行作业运行规划

上述两种模式可以在流程编写和任务投递两个层面，对作业运行的具体节点进行了选择。对于更普遍的作业运行约束，Achelous平台也提供了调度域的概念，可供管理员对一组用户进行统一管理。

管理员用户通过 Poros界面可以进行调度域的添加和管理。对于某个调度域而言，管理员可以向其中添加一到多个用户。当某用户被添加到调度域中后，其提交的作业会自动投递至对应服务器上运行。

在管理界面中，除了可以配置调度域中相应的服务器，也可以对调度域对应的任务优先级进行定义。

除了上述功能，管理员用户也可以进行资源预留。一旦资源被预留，这部分被预留的资源（CPU、内存等），不会被使用。

如果某个用户属于多个调度域，又需要任务投递到某个特定的调度域，则需要在job文件中指定。例如：

{
    ...
    "ScheduleDomains" : "dom1"
    ...
}