WDL 开发工具介绍

Vim WDL 插件

broadinstitute官方提供了在Vim环境下的WDL插件,提供基础的关键词、语法高亮等功能。其安装方式,可参考 https://github.com/broadinstitute/vim-wdl

VScode WDL 插件

VScode也提供了WDL语言的插件。用户可直接通过VScode插件管理进行安装。

WDL 语法校验工具

WOMtool 可以对WDL脚本进行语法校验,其网站为 https://cromwell.readthedocs.io/en/stable/WOMtool/

CWL 转化 WDL

目前,除了WDL之外,也有相当一部分生物信息流程是以CWL语言编写的。用户可以采用dxCompiler将CWL脚本转化为WDL脚本。https://github.com/dnanexus/dxCompiler

Powered by XTAO TechnologyLast Modified On:2021 2023-03-24 09:05:23

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